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Science+Science子刊連發(fā),Complete Omics如何改變疾病早篩領域?

2021-03-03 11:09
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2021年3月1日,《科學》雜志和《科學-免疫學》雜志在線發(fā)表了來自約翰霍普金斯醫(yī)學院Bert Vogelstein 教授和美國臨床多組學分子診斷公司Complete Omics Inc.共同作者的兩項新突破。文章中闡述了一種新的腫瘤個體化診治的方法,分別針對抑癌基因TP53和原癌基因K-Ras上的個體化基因突變。 靶向這兩個非常重要的癌癥基因的個體化治療在歷經(jīng)多年的研究后,終于在近期有所突破。

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Bert Vogelstein教授和Complete Omics公司在實驗中,首先通過基因檢測手段,確定了腫瘤相關基因突變,而后Complete Omics公司采用專利化的臨床蛋白組診斷平臺對個體化腫瘤治療靶點進行鑒定和定量,找出最具潛在治療價值的腫瘤新抗原靶點。最后,根據(jù)相應的多組學分子診斷結果,治療團隊采用雙特異性抗體分別針對TP53蛋白和K-Ras蛋白的特定突變位點進行靶向治療。

作為全球最知名的癌癥醫(yī)學科學家之一,Bert Vogelstein教授的大名自然不必多言。同時,我們知道Vogelstein教授的高影響力的論文基本都是獨立完成,極少選擇與商業(yè)公司合作,Complete Omics這家初創(chuàng)企業(yè)有何背景,又希望如何改變?nèi)缃竦募膊≡绾Y領域?

一句“Anything hard”引發(fā)的創(chuàng)業(yè)經(jīng)歷

“多組學并不是幾種數(shù)據(jù)的疊加和綜合分析,因為各個組學的深度、廣度、應用場景以及數(shù)據(jù)的優(yōu)缺點各有不同。多組學臨床應用是在深刻理解臨床需求和多種組學數(shù)據(jù)的自然屬性、切實進行臨床組學技術的原創(chuàng)性研發(fā),以及深入理解疾病分子生物背景的基礎之上建立和形成的。從2008年以來,我們一直專注于這個領域,積累了大量跨組學臨床數(shù)據(jù)和跨組學研發(fā)經(jīng)驗。Complete Omics公司必將竭盡全力為世界范圍的患者和醫(yī)生開發(fā)更多更好的技術!盋omplete Omics Inc創(chuàng)始人王磬博士說。

王磬最早畢業(yè)于南開大學,獲分子生物學學士和碩士學位;2007年赴美繼續(xù)攻讀博士,在美國約翰霍普金斯醫(yī)學院,師從世界腫瘤學界泰斗Bert Vogelstein教授,也就是本次發(fā)表的兩篇論文的主要作者之一,獲藥理學博士學位。在攻讀博士期間,王磬同時還在約翰霍普金斯布隆博格公共衛(wèi)生學院獲得生物統(tǒng)計碩士學位。博士畢業(yè)后的王磬留在了美國約翰霍普金斯醫(yī)學院繼續(xù)進行博士后研究,并隨后留校任教。目前,王磬在運營公司之余,還在世界著名的沃頓商學院MBA專業(yè)學習。

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左:Bert Vogelstein 教授;右:Complete Omics 創(chuàng)始人 王磬博士

Bert Vogelstein教授是享譽世界的癌癥遺傳學家,早在1980年代就系統(tǒng)闡述了基因突變引發(fā)癌癥的普遍規(guī)律,是TP53、APC、IDH1 等眾多癌癥基因相關研究的重要奠基人,論文總引用數(shù)超過 43 萬次。

王磬在回憶自己博士求學經(jīng)歷的時候曾寫到:“我仍然記得,第二次見Bert,他問我想做什么項目的時候,我的回答是‘Anything hard.’現(xiàn)在想來,真想為自己當時的勇敢點個贊!闭沁@樣的勇敢,讓王磬走上了多組學診斷方法研究的道路,并在臨床基因組和臨床蛋白組相關的診斷領域?qū)矣袛孬@。

2019年,王磬辭去約翰霍普金斯醫(yī)學院腫瘤學系的教職,創(chuàng)辦Complete Omics公司,在創(chuàng)業(yè)之初就獲得了數(shù)百萬美元的天使輪投資。Bert Vogelstein也大力支持自己學生的創(chuàng)業(yè)之路,出任Complete Omics的科學顧問。

融合多組學技術,解決早篩難題

目前為止的早篩技術,雖然檢測的靶標在不斷更新,尤其在癌癥領域,針對腫瘤基因相關突變、MSI、TMB、特定蛋白標記物和代謝標記物等不同靶標的相關研究也不斷取得著突破性的進展,但是近幾年的突破大多局限在單一組學,尤其是基因組數(shù)據(jù)層面上,未能向外擴張,與多組學技術相結合。同時,一些國內(nèi)外市場上的 “多組學”技術,往往是從早已商業(yè)化和標準化的平臺上采集幾種不同類型數(shù)據(jù)來進行多元分析,甚或加上人工智能分析的標簽,技術門檻較低,且并沒有出現(xiàn)實質(zhì)性的底層實驗室技術方面的原創(chuàng)性突破,也沒有體現(xiàn)出對不同維度組學數(shù)據(jù)和不同臨床適應性的深刻理解。

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王磬在Complete Omics的實驗室工作

Complete Omics想要做的事情,就是打破分子診斷的邊界,通過實驗室技術、儀器硬件平臺、和數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析方法這三方面硬科技的底層創(chuàng)新,將幾種數(shù)據(jù)類型的優(yōu)勢之處相互結合,形成包括臨床蛋白組分子診斷在內(nèi)的一系列多組學技術平臺,將人類疾病診斷和健康篩查的靈敏度和準確性推向新的高度。

Bert Vogelstein教授曾在幾年前創(chuàng)立Thrive Earlier Detection,一家液體活檢公司,通過檢測基因突變和蛋白變化來進行早期癌癥篩查。在2018年發(fā)表的一篇論文中,Thrive Earlier Detection的CancerSEEK已經(jīng)在部分癌癥類型中表現(xiàn)出70%的敏感性中位數(shù)和超過99%的特異性。由于出色的研發(fā)進展,Thrive Earlier Detection在2020年10月被癌癥早篩龍頭Exact Sciences以21.5億美元收購。

從技術路徑上講,Complete Omics和Thrive Earlier Detection有些相似,切入的場景,也同樣以早期篩查為主。但是Complete Omics的宏圖看來更加遠大,從泛癌種的癌癥早篩擴張到了泛疾病領域早篩。

這讓Complete Omics的前景市場更大,開發(fā)難度更高,但也讓他們有些前人的經(jīng)驗可借鑒。在過去的兩年中,Complete Omics集中力量開發(fā)了以“Complete360”為核心的臨床多組學平臺技術,尤其是在臨床蛋白組領域取得了突破性的進展。

目前“Complete360”已經(jīng)初步具備了面向患者的檢測能力,并推出了兩款核心LDT產(chǎn)品。一款檢測FDA已經(jīng)批準用于13種不同疾病的194個生物標志物;另一款則全面檢測血液中已發(fā)現(xiàn)與人類疾病相關的4550個蛋白以及協(xié)同檢測疾病相關基因突變,幫助診斷超過300種常見疾病。

這樣一來,由現(xiàn)有的產(chǎn)品提供相對穩(wěn)定的經(jīng)營收入,同時獲取臨床數(shù)據(jù),營收資金還能用于推動新產(chǎn)品的持續(xù)研發(fā),Complete Omics有能力在發(fā)展早期形成完整的商業(yè)閉環(huán)。

此次發(fā)表的兩篇文章則近一步鞏固了Complete Omics的臨床多組學平臺在世界范圍內(nèi)的領導地位,同時吸引了多家美國和歐洲的著名醫(yī)療服務和科研機構同他們開展臨床和科研服務合作。這些合作將會幫助Complete Omics完善在研的臨床多組學分子診斷平臺,使得公司能夠近一步突出優(yōu)勢,為患者和科學家提供更好的分子診斷服務。

本次發(fā)表的兩篇重磅文章,均由Complete Omics的技術平臺提供腫瘤多組學分子診斷支持。這也側面表現(xiàn)出該公司平臺目前已經(jīng)具備的世界領先的分子診斷實力和針對頂級期刊學術論文的科研支撐能力。王磬博士是其中一篇論文的共同通訊作者和另一篇論文的共同作者,并且Complete Omics的臨床蛋白組技術團隊參與了這兩篇論文的發(fā)表和相關專利申請,后續(xù)的成果轉化之路也將更加順利。

作者:郝翰

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