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CAR-NK中CAR的工程化和設(shè)計(jì)

前言?

人類(lèi)自然殺傷(NK)細(xì)胞占所有循環(huán)淋巴細(xì)胞的15%。NK細(xì)胞表現(xiàn)出抗腫瘤細(xì)胞毒性,無(wú)需事先致敏以及細(xì)胞因子和趨化因子的作用。由于NK細(xì)胞能夠識(shí)別和殺死腫瘤細(xì)胞,以 NK 細(xì)胞為基礎(chǔ)的腫瘤免疫治療領(lǐng)域越來(lái)越受到人們的重視。

嵌合抗原受體(CAR)是一種受體蛋白,它賦予免疫細(xì)胞新的能力,以靶向特定的抗原蛋白。CAR-T細(xì)胞治療在血液惡性腫瘤取得了巨大的成就。然而CAR-T細(xì)胞仍存在一些不足,例如在實(shí)體瘤的治療中顯示出很低的療效;此外,大多數(shù)的CAR-T細(xì)胞免疫療法需要自體過(guò)繼細(xì)胞移植,因?yàn)槌翘幚鞨LA屏障,否則異基因T細(xì)胞可能導(dǎo)致移植物抗宿主。℅VHD);另外,CAR-T細(xì)胞免疫治療可能會(huì)產(chǎn)生一些副作用,如細(xì)胞因子釋放綜合征。

最新的研究表明,CAR-NK細(xì)胞可能會(huì)克服 CAR-T細(xì)胞的上述缺陷,并顯示出顯著的抗腫瘤作用。CAR-NK細(xì)胞在腫瘤的免疫治療中展現(xiàn)出廣闊的前景。

CAR-NK的研究概況

CAR-NK臨床前研究的數(shù)量逐年增加,這體現(xiàn)在每年都在增加的關(guān)于CAR-NK的研究論文。

此外,在研究的靶標(biāo)方面,Her2是實(shí)體瘤最常用的靶點(diǎn),而CD19抗原在血液腫瘤中最常見(jiàn)。使用原代NK細(xì)胞的研究中,65%的人在研究B細(xì)胞惡性腫瘤,CD19是最受歡迎的靶點(diǎn)。有趣的是,在使用NK細(xì)胞系的研究中,研究實(shí)體瘤是血液惡性腫瘤的2倍以上。

在臨床研究方面, CD19-CAR-NK細(xì)胞對(duì)血液系統(tǒng)腫瘤有很高的應(yīng)答率。除了CD19外,淋巴瘤和白血病的CAR-NK細(xì)胞臨床研究也針對(duì)CD7(NCT02742727)和CD33(NCT02944162)。目前,有幾種針對(duì)血液惡性腫瘤的CAR-NK細(xì)胞臨床試驗(yàn)正在進(jìn)行中。

還有多項(xiàng)針對(duì)實(shí)體瘤的研究處于啟動(dòng)或招募階段。

?CAR結(jié)構(gòu)的設(shè)計(jì)

NK細(xì)胞上表達(dá)的功能性CAR分子由三部分組成:胞外結(jié)構(gòu)域、跨膜區(qū)以及胞內(nèi)的信號(hào)結(jié)構(gòu)域。胞外結(jié)構(gòu)域由一個(gè)信號(hào)肽和識(shí)別抗原的單鏈抗體片段(scFv)組成,一段鉸鏈區(qū)將這個(gè)結(jié)構(gòu)連接到跨膜區(qū),它也在細(xì)胞內(nèi)連接到包含激活信號(hào)的胞內(nèi)結(jié)構(gòu)域。成功的CAR設(shè)計(jì)是通過(guò)仔細(xì)的設(shè)計(jì)和功能測(cè)試相結(jié)合來(lái)實(shí)現(xiàn)的。

載體骨架和啟動(dòng)子

載體骨架包含表達(dá)CAR所需的所有元件,如啟動(dòng)子、polyA信號(hào)和轉(zhuǎn)錄調(diào)控片段。

啟動(dòng)子的選擇直接影響到轉(zhuǎn)基因的表達(dá)水平。目前,對(duì)不同啟動(dòng)子在NK細(xì)胞系中的CAR表達(dá)和功能的比較只有一次報(bào)道,而對(duì)原代NK細(xì)胞沒(méi)有比較數(shù)據(jù)。就這一次單個(gè)報(bào)告來(lái)看,還不能確定CAR-NK細(xì)胞的最佳啟動(dòng)子。

目前關(guān)于CAR-NK細(xì)胞的報(bào)道顯示,多種啟動(dòng)子被用于驅(qū)動(dòng)CAR的表達(dá),無(wú)論是細(xì)胞系來(lái)源的還是原代NK細(xì)胞。在原代CAR-NK和CAR-NK細(xì)胞系中,病毒啟動(dòng)子(CMV、MPSV、MMLV、SFFV等)比組成性活性啟動(dòng)子(如EF1α、CMV和PGK)更常用。

信號(hào)肽

在信號(hào)肽中存在著巨大的異質(zhì)性,這直接轉(zhuǎn)化為不同水平的蛋白質(zhì)分泌效率。對(duì)于CAR-NK和CAR-T細(xì)胞,還沒(méi)有確定最佳信號(hào)肽的比較研究。目前,CD8a-SP是原代NK細(xì)胞最常用的信號(hào)肽序列(16%,71%的研究中未公布)和NK細(xì)胞系的免疫球蛋白重鏈或輕鏈信號(hào)肽(29%)。

單鏈抗體

單鏈抗體片段是CAR的腫瘤抗原結(jié)合域,該結(jié)構(gòu)域?qū)Q定CAR-NK細(xì)胞的特異性和功能。

由于單鏈抗體不是抗體的天然形式,因此重鏈和輕鏈的順序是人工確定的。到目前為止,對(duì)于CAR-NK設(shè)計(jì),大多數(shù)更喜歡VH-VL方向,而不是VL-VH方向。Fujiwara等人證明重鏈和輕鏈的順序不影響T細(xì)胞上抗KDR CAR的表達(dá)水平。

此外,細(xì)胞可以配備多個(gè)單鏈抗體,從而擴(kuò)大CAR效應(yīng)細(xì)胞的抗原識(shí)別能力。在這里,有多種選擇:CARs可以用雙元件的載體轉(zhuǎn)導(dǎo),誘導(dǎo)兩個(gè)CAR結(jié)構(gòu)的表達(dá);或者將兩個(gè)單鏈抗體融合在一個(gè)結(jié)構(gòu)中,產(chǎn)生串聯(lián)單鏈抗體的“單柄”CAR。雖然這些技術(shù)已用于生產(chǎn)CAR-T細(xì)胞,但CAR-NK細(xì)胞仍未知。

目前大多數(shù)臨床CAR-T細(xì)胞試驗(yàn)都使用了來(lái)自小鼠抗體的單鏈抗體,這增加了抗小鼠IgG細(xì)胞宿主抗移植物病的風(fēng)險(xiǎn),這個(gè)問(wèn)題可以通過(guò)人源化或篩選全人抗體避免。然而不幸的是,由于這些CAR受體的嵌合特性,即使是人源化的單鏈抗體也可能誘導(dǎo)宿主抗獨(dú)特型免疫反應(yīng)。幸運(yùn)的是,在迄今為止數(shù)量有限的CAR-NK臨床試驗(yàn)中,沒(méi)有發(fā)現(xiàn)與抗CAR免疫反應(yīng)相關(guān)的重大副作用。

連接區(qū)

重鏈和輕鏈之間的連接區(qū)有助于穩(wěn)定單鏈抗體的構(gòu)象,過(guò)短會(huì)導(dǎo)致多聚體的形成,過(guò)長(zhǎng)可能導(dǎo)致水解或降低VH和VL結(jié)構(gòu)域之間的關(guān)聯(lián)。對(duì)于CAR-NK細(xì)胞,五肽GGGGS的多聚體應(yīng)用最為廣泛,通常為3個(gè)重復(fù)。另一個(gè)旨在增強(qiáng)蛋白水解穩(wěn)定性的連接體是Whitlow“218”連接體:GSTGSGSKPGSGEGSTKG。

目前,雖然大多數(shù)CAR-NK研究沒(méi)有提供連接細(xì)節(jié),但已有的研究報(bào)道中,有22項(xiàng)使用了G4S連接,有2項(xiàng)應(yīng)用了218連接。

鉸鏈區(qū)

鉸鏈區(qū)是連接單鏈抗體單位和跨膜結(jié)構(gòu)域的CAR細(xì)胞外結(jié)構(gòu)區(qū),它通常維持效應(yīng)細(xì)胞中穩(wěn)健的CAR表達(dá)和活性所需的穩(wěn)定性。大多數(shù)CAR-NK構(gòu)建使用CD8α或CD28胞外結(jié)構(gòu)域的衍生物或基于IgG的鉸鏈區(qū)。

鉸鏈區(qū)的類(lèi)型和長(zhǎng)度對(duì)CAR的功能活動(dòng)有重要影響。但是目前大多數(shù)信息全來(lái)自CAR-T領(lǐng)域,能否直接轉(zhuǎn)化為CAR-NK還有待證明。

在CD28和CD8α鉸鏈區(qū)之間的直接比較中,發(fā)現(xiàn)CD28更有可能促進(jìn)CAR分子的二聚化,因此,CD28鉸鏈區(qū)的CAR產(chǎn)生的激活刺激更強(qiáng)。雖然這可能是有益的,但也可能導(dǎo)致更嚴(yán)重的副作用。

IgG為基礎(chǔ)的鉸鏈區(qū)也廣泛應(yīng)用于CAR結(jié)構(gòu);贗gG鉸鏈區(qū)的一個(gè)主要優(yōu)點(diǎn)是結(jié)構(gòu)的靈活性,該結(jié)構(gòu)通常由IgG1或IgG4的FC部分或Fc部分的CH2/CH3結(jié)構(gòu)域組成。鉸鏈區(qū)的長(zhǎng)度可以調(diào)節(jié)以適應(yīng)抗原識(shí)別,但研究發(fā)現(xiàn),間隔區(qū)越短,細(xì)胞因子的產(chǎn)生越高,CAR-T細(xì)胞增殖越快,體內(nèi)持久性和抗腫瘤效果越好。

對(duì)于CAR-NK細(xì)胞,大多數(shù)研究在原代NK細(xì)胞(16/35)和CAR-NK細(xì)胞系(41/72)中均采用CD8α鉸鏈區(qū)。其它使用的鉸鏈區(qū)包括CD28、IgG Fc結(jié)構(gòu)域和DAP12。

跨膜結(jié)構(gòu)域?

跨膜(TM)結(jié)構(gòu)域連接CAR的胞外結(jié)構(gòu)域和細(xì)胞內(nèi)激活信號(hào)結(jié)構(gòu)域,CAR-NK最常用的TM部分來(lái)自CD3ζ、CD8和CD28,但其他如NKG2D、2B4、DNAM1也有被使用。

TM結(jié)構(gòu)域的選擇影響了CAR結(jié)構(gòu)在細(xì)胞功能上的活化程度。通常在NK細(xì)胞上表達(dá)的分子如DNAM-1、2B4和NKG2D的TM會(huì)導(dǎo)致更多的CD107a脫顆粒和更高的細(xì)胞毒性,因此,TM的具體來(lái)源將決定CAR-NK的活性。

TM結(jié)構(gòu)域的一個(gè)重要方面是,最佳TM區(qū)域應(yīng)遵循T細(xì)胞或NK細(xì)胞上跨膜蛋白的蛋白質(zhì)自然取向(N端到C端順序)。NKG2D雖然是一種強(qiáng)大的NK細(xì)胞激活劑,然而,天然NKG2D具有C端到N端的跨膜區(qū)。

目前,CD8α和CD28修飾的TM在原代CAR-NK細(xì)胞中最常見(jiàn),而CD28是CAR-NK細(xì)胞系的首選TM區(qū)域。

CAR-NK激活信號(hào)

CAR的細(xì)胞內(nèi)激活信號(hào)的數(shù)量決定了其屬于哪一“代”CAR。

第一代CAR-NK細(xì)胞與CAR-T細(xì)胞一樣,只含有CD3ζ信號(hào)。第二代和第三代CAR-NK分別攜帶一個(gè)和兩個(gè)額外的共刺激信號(hào),共刺激分子通常來(lái)源于CD28家族(CD28和ICOS)、TNFR家族(4-1BB、OX40和CD27)或SLAM相關(guān)受體家族(2B4)。到目前為止,唯一公布的CAR-NK臨床試驗(yàn)采用了第二代CAR-NK構(gòu)建,該構(gòu)建通過(guò)加入IL-15表達(dá)和誘導(dǎo)Caspase9增強(qiáng)活性。

目前大多數(shù)CAR結(jié)構(gòu)依賴(lài)于CD3ζ鏈信號(hào)域,強(qiáng)烈的激活信號(hào)對(duì)于誘導(dǎo)有效的抗腫瘤反應(yīng)很重要,但也可能導(dǎo)致效應(yīng)細(xì)胞的快速衰竭。因此,共刺激域的組合可用于校準(zhǔn)所需的免疫細(xì)胞反應(yīng)。與基于4-1BB的 CARs相比,基于CD28的CARs表現(xiàn)出更快的效應(yīng)器特征,誘導(dǎo)更高水平的IFN-γ、顆粒酶B、TNF-α。然而,這種強(qiáng)烈的共刺激信號(hào)也會(huì)導(dǎo)致活化誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡(AICD)。

相比較,4-1BB-CD3ζ信號(hào)優(yōu)先誘導(dǎo)記憶相關(guān)基因和持續(xù)的抗腫瘤活性。原因可能是4-1BB結(jié)構(gòu)域改善了CD28結(jié)構(gòu)域引起的T細(xì)胞耗竭。

如上圖所示,在CAR-NK細(xì)胞系和原代CAR-NK細(xì)胞的研究中,CD3ζ幾乎被普遍用作主要的激活域,其中大約一半攜帶一個(gè)額外的激活域,通常添加4-1BB或CD28。至于第三代結(jié)構(gòu),CD28/4-1BB/CD3ζ的組合是最常用的。

CAR的轉(zhuǎn)染或轉(zhuǎn)導(dǎo)載體

隨著基因修飾技術(shù)的進(jìn)步,許多方法被用于產(chǎn)生CAR-NK。兩種主要方法是病毒轉(zhuǎn)導(dǎo)(使用慢病毒或逆轉(zhuǎn)錄病毒),或轉(zhuǎn)染裸質(zhì)粒DNA、轉(zhuǎn)座酶DNA介導(dǎo)的整合以及mRNA電轉(zhuǎn)。

慢病毒

慢病毒能夠高效地轉(zhuǎn)導(dǎo)周期性和非周期性細(xì)胞,在基因治療領(lǐng)域得到了廣泛的應(yīng)用。迄今為止,已有14篇關(guān)于原代CAR-NK細(xì)胞和44篇關(guān)于CAR-NK細(xì)胞系的研究成功使用慢病毒作為載體。

在臨床前研究中,21項(xiàng)研究使用了第二代病毒,6項(xiàng)研究使用了第三代慢病毒來(lái)產(chǎn)生表達(dá)CAR的NK細(xì)胞系(17個(gè)未知)。在原代CAR-NK細(xì)胞研究中,5項(xiàng)研究使用了第三代慢病毒,7項(xiàng)研究使用了第二代慢病毒載體(2個(gè)未知)。

逆轉(zhuǎn)錄病毒

幾十年來(lái),逆轉(zhuǎn)錄病毒一直被用作基因治療載體。迄今為止,有20項(xiàng)使用CAR-NK細(xì)胞系的研究和15使用原代NK細(xì)胞的研究應(yīng)用了逆轉(zhuǎn)錄病毒。最近的一項(xiàng)I期臨床試驗(yàn)中,由逆轉(zhuǎn)錄病毒轉(zhuǎn)導(dǎo)的CD19 CAR-NK細(xì)胞治療CD19+非霍奇金淋巴瘤和慢性淋巴細(xì)胞白血病。在這項(xiàng)研究中,73%的患者有響應(yīng),8名患者中有7名獲得完全緩解。此外,在所有劑量水平下,CAR-NK輸注后30天內(nèi)反應(yīng)迅速。經(jīng)過(guò)一年的隨訪,仍然可以檢測(cè)到擴(kuò)增的CAR-NK細(xì)胞。輸注后,外周血中的CAR-NK DNA拷貝數(shù)保持穩(wěn)定達(dá)一年之久,這些結(jié)果首次表明逆轉(zhuǎn)錄病毒轉(zhuǎn)導(dǎo)的CAR-NK細(xì)胞可以在體內(nèi)長(zhǎng)期存活。

不同種類(lèi)的逆轉(zhuǎn)錄病毒被用來(lái)產(chǎn)生CAR-NK細(xì)胞。與γ逆轉(zhuǎn)錄病毒和慢病毒相比,RD114α逆轉(zhuǎn)錄病毒在原代NK細(xì)胞的轉(zhuǎn)導(dǎo)效率上更高。盡管使用不同的逆轉(zhuǎn)錄病毒可以在NK細(xì)胞中獲得長(zhǎng)時(shí)間穩(wěn)定的CAR表達(dá),但逆轉(zhuǎn)錄病毒系統(tǒng)的安全性仍然是一個(gè)值得關(guān)注的問(wèn)題,尤其是與更安全的慢病毒相比。

mRNA電穿孔

電穿孔CAR編碼mRNA是一種快速、有效但是作用短暫的一種方法。迄今為止,有9個(gè)關(guān)于CAR-NK細(xì)胞系和11個(gè)原代CAR-NK細(xì)胞研究使用了mRNA電穿孔。

一般來(lái)說(shuō),擴(kuò)增或活化的NK細(xì)胞的mRNA轉(zhuǎn)染效率遠(yuǎn)高于新鮮分離的NK細(xì)胞。由于mRNA的合成符合GMP的規(guī)定,并且電穿孔可以在潔凈室中進(jìn)行,因此通過(guò)mRNA電穿孔產(chǎn)生符合GMP的CAR-NK是可行的。然而,這種方法的主要缺點(diǎn)是CAR表達(dá)的窗口短暫:電穿孔后,CAR-NK細(xì)胞應(yīng)在7天內(nèi)輸回患者體內(nèi)。

睡美人轉(zhuǎn)座子

基于轉(zhuǎn)座子的系統(tǒng)可以在預(yù)定的位置高效地導(dǎo)入CAR轉(zhuǎn)基因,這是傳統(tǒng)方法所不具備的一個(gè)重要優(yōu)勢(shì)。轉(zhuǎn)座子主要通過(guò)電穿孔導(dǎo)入NK細(xì)胞,然后通過(guò)轉(zhuǎn)座子酶整合到宿主基因組中。有兩項(xiàng)研究應(yīng)用轉(zhuǎn)座子系統(tǒng)來(lái)產(chǎn)生CAR-NK細(xì)胞:一項(xiàng)使用NK-92-MI細(xì)胞,另一項(xiàng)研究將轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)染到iPSC細(xì)胞,然后分化成NK細(xì)胞。富集后,抗間皮素CARs在iPSC衍生的NK細(xì)胞上穩(wěn)定表達(dá),并在卵巢癌小鼠模型中發(fā)揮出作用。

CRISPR/Cas9

CRISPR/Cas9是一種強(qiáng)大的基因改造技術(shù),這項(xiàng)技術(shù)依賴(lài)于將Cas9蛋白與引導(dǎo)RNA一起導(dǎo)入NK細(xì)胞。最初,這種技術(shù)被用于原代NK細(xì)胞,以破壞CD38基因,旨在防止NK細(xì)胞與daratumumab (抗CD38)聯(lián)合使用時(shí)的自相殘殺,因?yàn)镃D38在NK細(xì)胞、多發(fā)性骨髓瘤和AML細(xì)胞上均有表達(dá)。

最近,CRISPR/Cas9被用于引入新基因。在一些采用HDR模板的研究中,使用K562-mIL-21擴(kuò)增的NK細(xì)胞獲得了超過(guò)75%的敲入效率。然而,在新鮮NK細(xì)胞中,敲入效率僅為3–16%?偟膩(lái)說(shuō),CRISPR/Cas9策略是一種很有前景的技術(shù),它可以用來(lái)精確地刪除、修復(fù)或?qū)胩囟ɑ,有望產(chǎn)生強(qiáng)大的抗腫瘤NK細(xì)胞。

小結(jié)

NK細(xì)胞是一類(lèi)獨(dú)特的抗腫瘤效應(yīng)細(xì)胞,具有不受 MHC 限制的細(xì)胞毒性、產(chǎn)生細(xì)胞因子和免疫記憶等功能。CAR-NK細(xì)胞療法是一個(gè)很有前途的臨床研究領(lǐng)域,對(duì)某些癌癥患者具有良好的安全性和初步療效。

目前,對(duì)CAR-NK細(xì)胞的研究越來(lái)越多,基于CAR-T細(xì)胞治療的成功經(jīng)驗(yàn),以及新技術(shù)和新方法的應(yīng)用,相信CAR-NK細(xì)胞治療一定能夠克服種種挑戰(zhàn),為腫瘤治療帶來(lái)新的突破。

參考文獻(xiàn):

1. Chimeric antigen receptornatural killer (CAR-NK) cell design and engineering for cancer therapy. JHematol Oncol.?2021; 14: 73.

2.?Natural Born Killers: NK Cells in Cancer Therapy. Cancers (Basel). 2020 Jul 31;12(8):2131

       原文標(biāo)題 : CAR-NK中CAR的工程化和設(shè)計(jì)

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